Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms