Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpv2Q9WTR1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms