Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms