Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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