Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms