Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms