Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc44a5Q5RJI2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc44a5Q5RJI2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc44a5Q5RJI2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc44a5Q5RJI2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc44a5Q5RJI2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc44a5Q5RJI2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc44a5Q5RJI2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc44a5Q5RJI2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc44a5Q5RJI2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc44a5Q5RJI2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc44a5Q5RJI2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc44a5Q5RJI2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc44a5Q5RJI2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc44a5Q5RJI2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms