Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TchpQ3TVW5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms