Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms