Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms