Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms