Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoP15409 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoP15409 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoP15409 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoP15409 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoP15409 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoP15409 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoP15409 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoP15409 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoP15409 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoP15409 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoP15409 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoP15409 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoP15409 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RhoP15409 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoP15409 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoP15409 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoP15409 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoP15409 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoP15409 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoP15409 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoP15409 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoP15409 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoP15409 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoP15409 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoP15409 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoP15409 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoP15409 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoP15409 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoP15409 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoP15409 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoP15409 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoP15409 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoP15409 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoP15409 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoP15409 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoP15409 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoP15409 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoP15409 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoP15409 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoP15409 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoP15409 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoP15409 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoP15409 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoP15409 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoP15409 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoP15409 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoP15409 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoP15409 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoP15409 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoP15409 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoP15409 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoP15409 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoP15409 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoP15409 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RhoP15409 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RhoP15409 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RhoP15409 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RhoP15409 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RhoP15409 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RhoP15409 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RhoP15409 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RhoP15409 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RhoP15409 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RhoP15409 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhoP15409 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhoP15409 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhoP15409 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhoP15409 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhoP15409 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhoP15409 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhoP15409 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhoP15409 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhoP15409 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhoP15409 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhoP15409 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhoP15409 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhoP15409 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhoP15409 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RhoP15409 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RhoP15409 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RhoP15409 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhoP15409 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms