Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prf1P10820 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prf1P10820 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prf1P10820 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prf1P10820 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prf1P10820 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prf1P10820 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prf1P10820 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prf1P10820 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prf1P10820 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prf1P10820 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms