Protein–RNA interactions for Protein: P09690

Chrnb1, Acetylcholine receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb1P09690 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms