Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srsf5O35326 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srsf5O35326 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms