Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4aF8VPX6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4aF8VPX6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4aF8VPX6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4aF8VPX6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4aF8VPX6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4aF8VPX6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4aF8VPX6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4aF8VPX6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4aF8VPX6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4aF8VPX6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4aF8VPX6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4aF8VPX6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4aF8VPX6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4aF8VPX6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4aF8VPX6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4aF8VPX6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms