Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brpf1B2RRD7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms