Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms