Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms