Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod3Q9R0E1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms