Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms