Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSN5

Phf23, PHD finger protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf23Q8BSN5 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm42435-201ENSMUST00000196630 1448 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm15104-201ENSMUST00000132626 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf23Q8BSN5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Phf23Q8BSN5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phf23Q8BSN5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phf23Q8BSN5 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Phf23Q8BSN5 Gm7609-203ENSMUST00000160058 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phf23Q8BSN5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phf23Q8BSN5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phf23Q8BSN5 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Phf23Q8BSN5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phf23Q8BSN5 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phf23Q8BSN5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phf23Q8BSN5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phf23Q8BSN5 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms