Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik4Q8BMF5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik4Q8BMF5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms