Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms