Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms