Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NipblQ6KCD5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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