Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

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Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ptpn13Q64512 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ptpn13Q64512 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn13Q64512 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn13Q64512 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn13Q64512 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn13Q64512 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ptpn13Q64512 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn13Q64512 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ptpn13Q64512 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ptpn13Q64512 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn13Q64512 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn13Q64512 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn13Q64512 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ptpn13Q64512 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ptpn13Q64512 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ptpn13Q64512 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ptpn13Q64512 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ptpn13Q64512 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn13Q64512 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ptpn13Q64512 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn13Q64512 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ptpn13Q64512 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn13Q64512 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn13Q64512 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn13Q64512 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn13Q64512 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn13Q64512 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn13Q64512 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms