Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms