Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm10Q3UTQ7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms