Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkain3Q3URJ8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms