Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf6Q3TWW8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms