Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms