Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb41P48193 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb41P48193 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb41P48193 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb41P48193 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms