Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kif3aP28741 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms