Protein–RNA interactions for Protein: P09690

Chrnb1, Acetylcholine receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb1P09690 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrnb1P09690 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb1P09690 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms