Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chil3O35744 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chil3O35744 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chil3O35744 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms