Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20425E9Q035 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm20425E9Q035 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20425E9Q035 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20425E9Q035 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20425E9Q035 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20425E9Q035 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20425E9Q035 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20425E9Q035 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20425E9Q035 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20425E9Q035 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20425E9Q035 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20425E9Q035 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20425E9Q035 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20425E9Q035 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20425E9Q035 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20425E9Q035 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20425E9Q035 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms