Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brpf1B2RRD7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms