Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms