Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt71Q9R0H5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms