Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Plod3Q9R0E1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod3Q9R0E1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms