Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtsfQ9R013 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtsfQ9R013 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CtsfQ9R013 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CtsfQ9R013 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CtsfQ9R013 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CtsfQ9R013 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CtsfQ9R013 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CtsfQ9R013 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CtsfQ9R013 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsfQ9R013 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms