Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms