Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smco4Q9JIS3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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