Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms