Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D3J9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D3J9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D3J9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D3J9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D3J9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D3J9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms