Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gps1Q99LD4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms