Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms