Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms