Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcl3Q8BVF2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms